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基因组和外显子测序服务流程

①原始数据去接头(adapter trimming)
  由于测序文库建立过程中需要给目标cDNA和基因组DNA加上可以用于扩增的引物序列,原始数据中往往带有无法被基因组识别的接头序列。因此在大规模序列比对之前,需要将原始数据预处理,包括去掉接头(adapter trimming)以及根据标记序列进行数据的分选。

②测序数据序列比对服务(mapping to genome)
  根据DNA样品的物种来源和样品类型,需要选择合适的基因组进行基因序列比对;最常用的人类基因组包括Ensembl和UCSF组装的Homo sapiens GRCh38基因组。服务器带有超大规模的芯片组,使得序列比对用时大大减少,可以最大限度的提高测序数据分析的服务速度。

样品和数据处理时间
测序: 测序文库构建 1~3天; 测序 3~14天
数据分析:5~30天

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